נתיב אקספרס נוסדה בשנת 2001 בעקבות החלטתה של ממשלת ישראל לאפשר מכרזים תחרותיים באוטובוסים של התחבורה הציבורית. נתיב זכתה בשניים מארבעת המכרזים הראשונים והיתה החברה הראשונה שהפעילה תחבורה ציבורית במסגרת תכנית התחרות באזור חדרה-נתניה.
החברה נעזרת בנתוני מיקום לוויין שמודיעים לנוסעים על זמני ההגעה לתחנות לאורך כל קו, באמצעות מערכת כריזה ושלטים אלקטרוניים. אינטרנט אלחוטי באוטובוסים של החברה מאפשר לנוסעים לגלוש באופן חופשי בזמן הנסיעה.
החברה מפקחת על כל הפעילות ממרכז בקרה הפועל מסביב לשעון, ומספקת ניהול צי מתקדם. מרכז בקרה זה משמש גם כמרכז למידע מקיף ללקוח. לחברת נתיב אקספרס הצטרפה בשנת 2021, כשותפה ובעלת מניות, "קרן נוי" - קרן התשתיות המובילה בארץ.